Vamos por partes:

¿Has llevado muchas rodilleras antes?¿puede ser falta de costumbre?

Aparte de eso para el sudor y que los velcros no te hagan daño hay una especie de "perneras" de tela que es mejor poner debajo, aunque en principio al llevar otra capa de ropa parece que vayas a ir más acalorado al final resulta que vas más comodo.

Lo de rozar con la moto, es raro puede que tengas estriberas demasiado estrechas, no hagas bién el apoyo (pies mirando para dentro) o puede haber otros motivos...por supuesto entiendo que las llevas por debajo del pantalón ¿no?

Yo intentaría llevarlas más tiempo a ver si te acostumbras y sinó pues comprarte unas más pequeñas.

Suerte.